谈话中我可以肯定提出死守南京的肯定就是唐生智了，下面一定是他出面要负责守卫南京，而历史上就是因为他的错误指挥，才导致几天内南京失陷，从而有了南京大屠杀。现在是改变这一切的时候了，不能再让唐生智负责守卫南京。
种种想法只在电光火石间，王海涛抢在了唐生智前面站了起来说道：“委座，卑职原带九十师负责固守南京。”蒋介石朝王海涛看去，微笑着说道：“是海涛啊，很好，海涛在上海可是打出了赫赫威名，让日军闻风丧胆啊！由你来负责守卫南京我是放心的，不过一个九十军人数太少了，这样，就由你来负责固守南京，我再给你调派一些部队，你先行视事，有什么要办的马上去办，命令随后会传达。”
就这样王海涛一下成了南京城防总司令，这一任命让许多人都觉得不可思议，凭这个王海涛的资历怎么也不可能担任这样的一个高位，随既众人也就释然了，这南京城防总司令可是不好当，守住了固然是大功一件，可日军的几十万大军是那么好对付的吗？万一失守了，那可就是千夫所指了。
随后的二天里，派给王海涛的部队不断增加，计有叶肇的第六十六军[含一五九师、一六零师]、俞济时的七十四军{含五十一师、五十八师}、孙元良的第八十七师、王敬久的第八十八师、宋希濂的第三十六师、桂永清的教导总队、何知重的一零三师、霍守义的一一二师。加上九十军的三个师，总兵力己经超过了十万人。
不过这些部队基本上都是经过上海战役打残后整补的部队，只有桂永清的教导总队是全德械装备的劲旅，应该是除了九十师以外最有战斗力的一支部队了。就这样蒋介石仍然从汉口紧急调来了徐源泉的第二军{含四十一师、四十八师}增援南京。
这时南京总指挥也要向武汉迁移，迁移之前，何应钦把南京的几座大型仓库全部移交给了王海涛，里面不仅有大量的武器弹药，还有各种军需物资。这次王海涛带回来的军火也全部在内。是钢就要用在刀刃上，王海涛接管了仓库后，第一件事就是给几个装备不好的地方师进行换装。
第二件事就是让桂永清的教导总队组建重炮旅和高炮旅，并把五十门一五零重*炮和一百门高射炮全部交给教导总队使用。
第三件事就是由教导总队派人在燕子矶抢修永固工事，并调二个重炮营，二个高炮营至燕子矶阵地封锁长江江面，阻止日军军舰沿江而上。这个什务是很艰巨的，这个阵地要面临日军舰炮的轰击和飞机的轰炸，还要面对步兵的攻击。面对这样的任务，桂永清毫无惧色，毅然接受了下来。
经过了二天的思考和研究，王海涛和下面部队的主官制订了防御计划。南京防御分成三道防线，第一道最外围的防线是马鞍山至溧阳至镇江一线，镇江由何知重的一零三师驻防，溧阳由九十军的九十一师驻防，马鞍山由霍守义的一一二师驻防。
第二道防线由京芜路上的大胜关起至淳化镇至汤山镇至龙潭镇成弧型防御阵地。这条防线由七十四军的二个师和孙元良的八十七师驻守。第三道阵地是南京城的复廓阵地，从江宁要塞至雨花台至仙林镇至紫金山一线，这也是南京城外的最后一道阵地了。
由一五九师加强江宁要塞，由第九十军的第九十二师守雨花台，由六十六军的一六零师守仙林镇，由九十军的九十师守紫金山。宋希濂的三十六师守下关，王敬久的八十八师守燕子矶外围。桂永清的教导总队除了守燕子矶的部队外，在城内做巷战准备。宪兵司令部司令萧山令负责率领全部宪兵维持南京市内治安和秩序。
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